EOS 6D Mark II采用全45点十字型自动对焦感应器+全像素双核CMOS AF技术，像素从一代的2020万提升至2620万有效像素，屏幕样采用可触摸式翻转屏，支持HDR短片以及4K延时短片等视频拍摄功能，可通过Wi-Fi/ NFC/ 蓝牙进行图片传输。

EOS 6D Mark II相比一代造型上最大的变化就是采用了3英寸的触摸翻转屏，屏幕可水平旋转约175°，向前旋转约180°，向后约90°。为了提升易用性，可触摸翻转屏可以说是佳能近期推出产品的“标配”，其他方面肩屏设计和背部按键布局和上一代几乎没有区别，使用6D的用户可以平滑过度。同时6D Mark II的机身采用了防水滴防尘处理，可应对不那么恶劣的拍摄环境。

EOS 6D Mark II在性能方面提升了对焦系统，45点十字型自动对焦感应器以及全像素双核CMOSAF技术相比6D的11点自动对焦/反差对焦提升不少。搭载DIGIC 7影像处理器和2620万像素的全画幅CMOS相比EOS 5D Mark III也有一定优势，同时配备了7560像素 RGB+红外测光感应器，最高连拍速度为6.5张/秒，标准感光度范围达到ISO 100-40000，支持全高清Full HD/60P短片、HDR短片以及4K延时短片拍摄。虽说快门速度依旧是1/4000以及没有提供对焦摇杆，但是对焦性能、成像素质以及其他方面的提升让6D Mark II作为一款入门级全画幅机型变得不再只是单纯的“入门”。